他的身份亦很快被卡卡西揭穿，当大蛇丸的行动失败、双手被三代目火影废去后，兜跟砂隐村的叶鬼一同离去。
木叶隐村之战后，砂隐村亦向木叶隐村投降。
此时大蛇丸的双手被三代的尸鬼封尽废去，不但要面对难以忍受的痛楚，而且也使不出忍术。
作为大蛇丸身边的心腹及医疗忍者，他特制各种药物，但只能稍减大蛇丸的痛楚。
最后决定一起前往寻找“传说三忍”之一、拥有高超医疗忍术的纲手，让她治疗大蛇丸的双手。
后来他们在短册街的城堡处找到了纲手。大蛇丸向纲手提出条件，只要她肯答应医治，就可以把她重要的人──断及绳树进行复活，以及不会摧毁木叶隐村为条件。
纲手尽管很想见到亲人，但她知道大蛇丸是不会轻易放过摧毁木叶隐村的机会，便假装肯医治大蛇丸，然后对他施以偷袭。
兜看出纲手的偷袭，立即掷出手里剑分开大蛇丸及纲手。纲手跟大蛇丸、药师兜之战瞬间展开。
兜认为在城堡的地方不利于跟具有怪力的纲手对战，于是便把纲手诱至山丘处。
跟纲手一路打到山丘后，他服下兵粮丸，并使出具攻击力的医疗忍术，把查克拉注入纲手手及腹的肌肉中，并加以损伤。
对于兜的高超医疗忍术及身手，纲手也感到吃力。后来更对纲手胸口打了一掌，使其难于呼吸。
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