在筛选首任火影之时，柱间原本打算让斑来当火影，但却遭到扉间的极大反对。
除了柱间支持斑做火影，其余木叶隐村所有族群的村民都支持柱间来做火影。斑被木叶所有的族群孤立了起来。
于是斑决定离开村子。在斑离开村子之际，柱间对宇智波斑百般挽留，他告诉斑他视斑为火影的左膀右臂，是柱间的兄弟，希望斑能够辅佐他，总有一天民众会发现斑的优点。
到时候斑就是第二代火影，然而斑早就预料到在千手柱间死后继承火影大位的绝对是千手扉间，那样宇智波一族有朝一日必定会被抹杀。
斑明白这点，所以号召宇智波族人跟自己离开村子，却没有一个人愿意追随斑。
斑感到极为惭愧，自己连弟弟都没能守住，当初答应弟弟泉奈要保护好宇智波族人，现在也因此办不到了。
斑清楚除了柱间没有人能和他坦诚相待。随后斑询问柱间愿意为了村子割舍扉间还是斑，柱间犹豫了，因为斑足够了解柱间，知道这是柱间的底线。
因此，宇智波斑坚持离开木叶，寻找自己想要的“真正的和平”。后来斑人间蒸发，没有人再听到过他的消息。
若干年后，斑突然回来向木叶发起袭击，企图摧毁自己曾经与柱间一起建立的村子。
柱间为了保护村子挺身而出与斑展开激烈的对战。斑利用写轮眼的强大瞳力操纵着尾兽中战斗力最强的九尾与千手柱间决斗，而千手柱间则以仙人模式下的木遁忍术与之应战。这场惊天动地的战斗后来被刻印在世人的记忆中，夜以继日的战斗改变了战场的地形。
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